Phường Thạch Linh được chia thành 12 khối phố: Linh Tiến, Vĩnh Hoà, Hợp Tiến, Tuy Hòa, Hòa Linh, Nam Tiến, Nhật Tân, Linh Tân, Đại Đồng, Tân Tiến, Yên Đồng, Bắc Tiến.

Các xóm của xã Thạch Linh (cũ):Yên Hòa, Vĩnh Hòa, Tuy Hòa, Linh Tiến, Yên Đồng, Đại Đồng, Tân Tiến, Linh Tân, Nhật Tân, Hợp Tiến, Nam Tiến, Ô Sả.